Trên địa bàn huyện có các tuyến chính: Quốc lộ 26, đường Trường Sơn Đông, Tỉnh lộ 13 (đường 693 - Xã Cư Prao), đường 693 (M'Drắk - Phú Yên). Có đường ô tô đến trung tâm tất cả các xã và được nâng cấp (nhựa hoặc bê tông hóa), các tuyến đường được đổ nhựa đầu tiên là đường Nguyễn Tất Thành (đoạn Quốc lộ 26 qua huyện M'Drăk), Tỉnh lộ 693 (đi qua các xã Krông Jin, Ea Riêng, Ea M'doal giáp huyện Sông Hinh, tỉnh Phú Yên, dài 40 km), Tỉnh lộ 13 (nối từ đường 693 đoạn tại xã Krông Jing đi xã Cư Prao, dài 30 km), Ea Pil - Cư Prao (dài 12 km)...Hiện đã có xe buýt nối trung tâm huyện và thành phố Buôn Ma Thuột do Hợp tác xã Quyết Thắng triển khai (tuyến Express). Từ huyện, đã có tuyến xe khách đến hầu hết các cùng trên cả nước: miền Bắc, Thành phố Hồ Chí Minh, Bắc Tây Nguyên, duyên hải miền Trung, Đông Nam Bộ...